工業鹽酸的一大主要用途是制備有機化合物，例如合成PVC塑料的原料氯乙烯、聚碳酸酯的前體雙酚A、催化膠黏劑聚乙烯醇縮甲醛、抗壞血酸等。企業合成PVC時通常不用市售的，而使用內部制備的鹽酸。鹽酸在制藥這些方面也有很大的用途。

鹽酸一個重要的用途是酸洗鋼材。在后續處理鐵或鋼材（擠壓、軋制、鍍鋅等）之前，可用鹽酸反應掉表面的銹或鐵氧化物。通常使用濃度為18%的鹽酸溶液作為酸洗劑來清洗碳鋼。剩余的廢酸常再用作氯化亞鐵溶液，但其中重金屬含量較高，故這種做法已經逐漸變少。酸洗鋼材工業發展了鹽酸再生工藝，如噴霧焙燒爐或流化床鹽酸再生工藝等。通過對廢酸的回收，人們建立了一個封閉的酸循環。副產品氧化鐵在各種工業加工流程中也有較多應用。在分析化學中，用酸來測定堿的濃度時，一般都用鹽酸來滴定。用強酸滴定可使終點更明顯，從而得到的結果更精確。在標準大氣壓下，20.2%的鹽酸可組成恒沸溶液，常用作一定氣壓下定量分析中的基準物。其恒沸時的濃度會隨著氣壓的改變而改變。鹽酸常用于溶解固體樣品以便進一步分析，包括溶解部分金屬與碳酸鈣或氧化銅等生成易溶的物質來方便分析。

鹽酸是一種無機強酸，在工業加工中有著廣泛的應用，例如金屬的精煉。鹽酸往往能夠決定產品的質量。