原料用于加工有機大米的稻谷應(yīng)來源于頒證的有機稻谷生產(chǎn)基地，不得混入來自非有機稻谷生產(chǎn)基地的稻谷，不得混入摻假的、含雜質(zhì)的以及品質(zhì)變劣的原材料。有機稻谷的運輸、驗收、貯存操作應(yīng)避免機械損傷、混雜和污染，并完整準(zhǔn)確地記錄好原料的來源和流轉(zhuǎn)情況，執(zhí)行備案登記制度。再加工和深加工產(chǎn)品所用的主要原料應(yīng)是有機原料，有機原料按質(zhì)量計不得少于95%。

加工廠有機大米加工所處的大氣環(huán)境不低于GB3095中規(guī)定的二級標(biāo)準(zhǔn)要求。加工廠址要遠離垃圾場、醫(yī)院200m以上；離經(jīng)常噴灑化學(xué)農(nóng)藥的農(nóng)田500m以上，距交通主干道50m以上，距排放“三廢”的工業(yè)企業(yè)1000m以上。有機大米加工用水應(yīng)達到GB5749的要求。

加工設(shè)備選用先進的環(huán)保組合式的精加工設(shè)備；要有去石、去鐵、去雜設(shè)備；并配備拋光機及色選機。產(chǎn)品在整個加工流程中不得與鉛及鉛銻合金、鉛青銅、錳銅、鉛黃銅、鑄鋁及鋁合金材料接觸。高噪聲不得超過80dB。強烈震動的加工設(shè)備應(yīng)采取必要的防震措施。