生物菌肥是近幾年發展起來的新型肥料，利用生物發酵技術生產的有益生物菌活態菌制劑，充分利用有益菌群分泌百的生物活性物質分解土壤中不能被植物根系吸收的礦物質，成為能被植物根系吸收利用的礦質營養；調節土壤的酸堿度度、增加土壤有機質、促進根系生長、改善土壤生態環境，并能抑制土壤中雜菌及病原菌對棗樹根系的危害，是一種不用能源、充分利用土壤中的礦質資源、對環境無害的新型肥料，是生問產無公害果品的理想肥料，有廣闊的發展前景。生物菌肥與答有機肥混合一起施用，既利于有益菌群的加速繁殖，又加速有機肥的分解，效果更好。目前市場上有固氮菌肥、磷細菌肥、硅酸鹽細菌肥料。復合微生物肥料是上述3種菌肥的混專合體。

生物菌肥是以微生物的生命活動導致作物得到特定肥來料效應的一種制品，是農業生產中使用肥料的一種。其在我國已有近50年的歷史，從根瘤菌劑——細菌肥料——微生物源肥料，從名稱上的演變已說明我國微生物肥料逐步發展的過程。 微生物肥料中有益微生物能產生糖類物質，占土壤有機質的0.1%，與植物粘液，礦物胚體和有知機膠體結合在一起，可以改善土壤團粒結構，增強土壤道的物理性能和減少土壤顆粒的損失，在一定的條件下，還能參與腐殖質形成。所以施用微生物肥料能改善土壤物理性狀，有利于提高土壤肥力。

生物菌肥可以提高土壤肥力。這是生物肥料的主要功效，例如各種自生、聯合或共生的固氮生物肥料，可以固定空氣中的氮素，增加土壤中的含氮量；多種分解磷、鉀礦物的百微生物，如硅酸鹽細菌能分解土壤中的鉀長石、云母及磷礦石，使其中難溶的磷、鉀有效化度。（2）制造和協助農作物吸收營養。有些菌肥如“5406”抗生菌肥施用后，由于微生物的活動，不僅能增加土壤有問效養分，還能產生多種激素類物質和各種維生素，從而促進作物的生長；根瘤菌肥中的根瘤菌向豆科植物一生提供的氮素，占其一生需要量的30%～80%。